净化工程主要的组成部分有六大部分，分别为：地面系统、风管系统、自控系统、电气系统、给排水系统、空气过滤系统六大部分。
地面系统：一般采用环氧树脂洁净地面。 围护结构系统：简单说是顶、墙、地三部分，即组成三维密闭空间的六个面。往细的说包括门窗、装饰圆弧等；
风管系统：包括送风、回风、新风、排风管道、末端及控制装置等；空调系统：包括冷（热）水机组（包括水泵、冷却塔等）（或风冷管道机级等），管路、组合式净化空调箱（包括混流段、初效段、加热段、制冷段、除湿段、加压段、中效段、静压段等）；
自控系统：包括温度控制、温度控制、风量风压控制、开启顺序和时间控制等；
电气系统：照明、动力、弱电三部分，包括净化灯具、插座、电气柜、线路、监控、电话等强弱电系统；
给排水系统：给水、排水管道、设施及控制装置等；
空气过滤系统：初中高效过滤器等其他净化设备：如臭氧、紫外线灯、风淋（包括货淋）、传递窗、超净工作台,互联锁等净化辅助设备
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